您现在的位置是:亞星網 > 音乐经典
途径涉及多个关键基因
亞星網2025-07-25 18:55:16【音乐经典】0人已围观
简介5、全基因组变异图谱及关键途径基因变化分析全基因组变异图谱分析WGMP),是结合每个样品的测序Reads对参考基因组的覆盖情况和SNP、InDel的分析结果,以参考序列为标尺,把Reads覆盖情况和S
5、比较全基因组变异图谱及关键途径基因变化分析
全基因组变异图谱分析(WGMP),基因是组分结合每个样品的测序Reads对参考基因组的覆盖情况和SNP、InDel的比较分析结果,以参考序列为标尺,基因把Reads覆盖情况和SNP、组分InDel的比较分布情况展示到环形的变异图谱上。从图上可直观比较Reads薄盖度的基因高低与变异分析结果的分布情况(图6)
赤藓糖醇是戊糖磷酸途径(PPP途径)的代谢产物,途径涉及多个关键基因。组分通过全基因组变异图谱的比较数据深入分析,赤藓糖醇合成途径中的基因关键基因转酮酶TKL1(YALI0_E06479g)有两个碱基发生单核苷酸多态性(SNP)变化:位于染色体CR382131.1上739638、740216位的组分碱基,参考基因组为A、比较T,基因Yarrowia lipolytica BBE-I7为G、组分G,这分别对应转酮酶TKL1的第412位和220位氨基酸。染色体CR382131.1上739638位碱基变化后与原碱基对应的三联密码子是同义密码子,因此氨基酸没有变化。740216位碱基的变化,导致该酶第220位氨基酸由赖氨酸变为谷氨酰胺。赤藓糖还原酶ER(YALI0_F18590g)也有两个碱基发生单核苷酸多态性(SNP)变化:位于染色体CR382132.1上2483635、2483794位的碱基,参考基因组为G、C,Yarrowialipolytica BBE—17为C、T,但是这两个碱基的变化并没有引起赤藓糖还原酶ER的氨基酸序列发生变化。
四、结论与展望
通过比较基因组分析,可以从基因组全局角度了解菌株,然后细致分析与目标途径相关的基因变化。比较基因组结果显示,Yarrowialipolytica BBE—17整个基因组有8078个小片段插与缺失变化(InDel),4256个基因发生了单核苷酸多态性变化(SNP),129个基因组结构变异(SV),142个DNA拷贝数变异(CNV)。但是与赤藓糖醇合成途径(图7>直接相关的只发现有2个关键途径基因TKLi、ER发生单核苷酸多态性变化(SNP),并且仅有一个氨基酸发生改变。
从基因组结构变异和DNA拷贝数变化来说,基本全为缺失型,说明Yarrowialipolytica BBE—17部分代谢活动受到抑制,这可能在一定程度上促进了其赤藓糖醇代谢通路的增强。基于此可以推测:关键途径基因的单核苷酸多态性变化(SNP)并不是Yarrowialipolytica BBE—17菌株具备积累赤藓糖醇能力的主要原因,应该是基因组全局的组装差异使Yarrowialipolytica BBE—17的整体代谢网络与模式菌株不同,这也是目标代谢途径加强和目标产物积累的主要原因。
1998年Stemmer等人提出了基因组重排技术(Genomeshuffling),为分子育种开辟了一条新的思路,但是高随机性和高筛选难度限制了该技术的推广应用。覃重军等人将酵母的16条染色体合并为一条染色体,成功获得了单染色体酵母,为基因组理性编辑和理性基因组工程育种提供了可能。本文通过比较基因组学揭示的研究内容,不仅为进一步优化亚罗解脂酵母生产赤藓糖薛的能力提供信息参考,也向理性基因组工程育种技术的快速发展提出了期待。
声明:本文所用图片、文字来源于《中国食品添加剂》,版权归原作者所有。如涉及作品内容、版权等问题,请与本网联系。
相关链接:赤藓糖醇,磷酸,氨基酸
很赞哦!(3)
热门文章
站长推荐
友情链接
- 「产品推荐」药典2341农药溶液标准物质,欢迎选购!
- 玻璃池窑耐火材料的使用要求及应用情况,行业资讯
- 「伟业16周年直播0元购」麦芽糖、葡萄糖、乳糖等标准物质现货供应,新客免费试用!
- 高锰酸钾滴定溶液标准物质的深入探讨与实践指导
- 小作坊实现大改造 南京市场监管部门助力网红经济品质升级
- 玻璃行情在平稳中走向节前尾声,行业资讯
- 氯化钾溶液:确保实验结果稳定可靠
- 新泰市谷里镇,“全国日用玻璃之乡”呼之欲出,企业新闻
- 小作坊实现大改造 南京市场监管部门助力网红经济品质升级
- 广东“保健食品科普”主题巴士上线
- 豪情故事短篇50字开适夜读的感情文章!感情故事段子素材
- 感情故事短篇好文男女感情话题素材感情类电台文本
- 别再等了,那个618便是进足华为Mate 60 Pro+旗舰足机的最好机会!
- 《元梦之星》建设需供公布 民圆保举ios安卓建设一览
- 刘德华支别女亲后复工:蓄着胡子 尽隐蕉萃怠倦
- 蒋勋的感情经历祝贺的四字案牍豪情故事大年夜齐少篇
- bai ?云区黄石街构造渣滓分类线上饱吹活动
- 《有朵云像你》定档跨年 屈楚萧王子文CP感拉满
- 光枯保时捷设念开叠屏足机暴光 代号“光枯911”
- 数码相机拍照片是利用了,数码相机拍照片是利用了甚么足艺
- 芒种农业品牌岁时骨气
- 女逝世奉告您感情经历感情电台稿子伤感热面感情故事
- 数码相机哪个品牌最好最耐用的,数码相机哪个品牌最好最耐用的足机
- 感情类的做文感情案牍少篇大年夜齐
- 努比亚Z60 Ultra卖价3999起 拆载骁龙8 Gen3措置器
- 小米足机如何扩容足机储存
- 英特我酷睿Ultra乌科技掀秘 何故成为AI PC的基石?
- 凄好哀伤散武功愈系电台好文少篇!深夜鸡汤感情漫笔
- 明智与感情电影图片周杰伦案牍配图烦闷案牍少句子
- 感情文章大年夜齐简短理性与理性音乐会2024/4/29女逝世奉告您感情经历
- 台积电董事少刘德音去岁退戚 发起副董事少魏哲家接任
- 迎秋有礼 钜惠开购!三星Galaxy智妙足机三月热销中
- 李筱懿小我感情经历进了心的人感情语录治愈系漫笔小故事
- 专主自曝iPhone 15 Pro后摄被冻裂 自称大年夜概率公费维建
- 刀郎临时停更音乐视频 辟谣他购版权给大年夜家免费听
- AI赋能,OPPO Reno12系列助您进建心试两没有误
- 热面文教做品中国文教做品网花市文教网站
- 仳离感情经历如何写感情小短片50字女逝世的感情需供
- 夜听《累了》笔墨版夜景案牍短句净净烦闷案牍少篇备记录
- 早安电台治愈好文感悟色采与感情